FINALLY!!!
Problém vyřešen. zjistil jsem že PDF je velmi tvrdohlavý formát a to co by se jiným mohlo zdát jako průhledná, se mu zdá jako průhledně modrá(nevím kde na to tvůrci přišli) tím pádem jsem tam upravil nějaký vzorkování a konverzi barev a další blbiny a vypadá to k světu. teď už mi jen zbývá zjistit, proč PDF vidí linky tam kde nejsou a nikdy nebyly...