samozřejmě že si pomůžeš QoSkou na routeru. To je právě ten vtip, že router "jednoduše" zpozdí/zbrzdí/dropne "příliš rychlá" spojení typu FTP a "upřednostní" jiná spojení na jiných portech - a bude to fungovat pro všechny PC v LAN, nejen pro tvůj PC (což bývá typický problém, user si nastaví limity, které mu druhé PC v zápětí "zahluší". BTW QoS má v sobě i např. DSL router Asus TI4631 (je trošku zjednodušená, ale IMHO by to fungovat mělo).
Jednoduše řečeno: QoS aplikovaná na routeru není schopna "navázat se" na aplikaci (jako netlimiter), ale jinak je schopná agregovat podle IP a portu (obojí odchozích i cílových)