Nepochopil som, čo presne potrebuješ vyriešiť, viď otázky nižšie.

Prvé, čo mi napadlo, sú klasické systémy pre správu verzií - CVS, SVN, Git a pod. V takomto prípade používateľ musí nainštalovať klienta.

Ďalšia možnosť je, že používatelia si stiahnu tie súbory cez webové stránky alebo FTP. To si môžu automatizovať nejakým baťákom. Ale nie je tam tá správa verzií - ak používateľom stačí posledná verzia a nové verzie budú nahrávať len administrátori, tak by to šlo kombináciou s prvou možnosťou (admini by si nainštalovali potrebný SW, ostatní by si vystačili s baťákmi).

Takže otázky sú:
Kto vytvára nové verzie tých dokumentov a vkladá ich do systému?
Potrebujú sa používatelia dostať k predchádzajúcim verziám?
Stačí, že súbory budú sprístupnené cez HTTP alebo FTP, alebo chceš riešiť aj automatické stiahnutie?
Čo má byť umiestnené v Program Files - sťahované súbory alebo ten program, ktorého inštalácii sa chceš vyhnúť?
Z čoho vznikla podmienka umiestnenia v Program Files?