Máš to blbě vymyšlený a navíc narážíš na neznalosti jazyka. JavaScript nemám rád, protože se mi blbě ladí (možná jen nemám vhodný nástroj - dělám to přímo v html a syntaktické chyby mi občas píše jen prohlížeč).
To, co píšeš že si s tím nevíš rady je vcelku jednoduché, stejně jako u toho alert...

document.write("Právě jsou: "+arr[hod]+" hodin "+arr[min]+" minut "+arr[sec]+" sekund");