určitě to jde řešit. Například tak, že místo ppt budeš spouštět nějaký skript (bat, vbs apod.), který si otestuje, zda už mu něco neběží, a případně to před spuštěním prezentace típne.
Stejně tak jde přes vbs řešit "promítání" PDF, a to tak, že otevřeš PDF a následně budeš do readeru opakovaně s nějakou rozumnou prodlevou odesílat přes VBS klávesové úhozy (např. pgdn), kterými budeš listovat.