Je nějaký vážný důvod k tomuto kroku? V zásadě by to mělo jít, ale z principu si zaděláváš na problémy. Musíš nastavit v BIOSu odkud se má bootoat, externí HDD bude nejspíš připojen přes USB, takže drasticky klesne přístupová doba k disku, rychlost zápisu a už to je důvod proč to nedělat.