Nejsem přes php moc odborník. S mysql_affected_rows() jsem se dostal nejdál tak, že mi to vypíše např. update 1800 položek. Vím že v DB jich je 1798 a 2 jsou v csv navíc

A kdy to voláš? Tech zpusobu je asi víc jak se dostat k těm datum, ne? Například to nainsertovat a zase si to proselektovat. Pak mužeš to affected_rows použít pro každý řádek a tedy bud tam bude 0 a nebyl tam a nebo 1 a byl tam.