Rozhodně bych ti nedoporučoval vypínat všechny funkce AVG, protože pak bys nebyl vůbec chráněn.
Co se týče skenování a aktualizací - vše lze naplánovat, jak ti to vyhovuje. Navíc u testů můžeš zvolit prioritu (tedy jaké zátěži můžeš PC aktuálně podrobit).
Jakou verzi AVG používáš?