A co ti brání se složkou Windows pracovat v Linuxu? Budeš se stejnými soubory pracovat v obou systémech (Lin i Win). Tak se běžně pracuje. Neupřesňuješ to více, takže předpokládám, že je možné mít disk s Widlema přítomen. Pak pracuješ s oběma systémy se stejnými soubory. Nějaké kopírování a kontrola, který soubor je novější, je na draka. Jinak pro to existuje pro Linux výborný program LuckyBackup.