K tiskárně tam máš nainstalovaný nějaký Control panel, ne?
Z něho by skenování mělo fungovat. To je asi nějaké prokletí Canonu.
Měl jsem stejný problém, i když s jinou tiskárnou od Canonu.
Zkus jiný ovladač: http://www.freeprinterdriverdownload.org/download- canon-pixma-mx360-driver/ (neověřeno).