bude mi to brát adresy v IPv6?

Může a nemusí. To záleží na jakém protokolu spolu komunikují (Server a klient). Pravděpodobnější bude protokol IPv4.

nestane se že jí to dá jako parametr IPv4 adresu

Může se stát .

co se stane pak, jestli něco?

???
Co by se pak mělo stát? Nevím v jakém kódu to používáš, takže ti nemohu poradit.
$_SERVER['REMOTE_ADDR'] v tom můžeš získat jak IPv6 tak IPv4. Proto udělej svoji aplikaci kompatibilní na oba druhy protokolů a máš vyhráno.