mám taky různé flashky emtec, o obsah jsem ještě nepřišel.

nešvarem dnešních flashek je chybějící indikační ledka. je hezké, že si systém myslí že kamsi vyflushnul data, ale řadič flashky je stále ještě řadí - bez ledky to nepoznáš.
ve tvém případě, kdy flashku používáš jako pracovní adresář a aplikace na ní rozvine dočasný soubor, si o ztrátu dat rovnou říkáš.