Takže řešení jsem nenašel, když problém shrnu, tak APE soubor je asi v 10% poškozen. Přehrát ve WinAmpu jde, avšak když najede na poškozené místo, tak to hodí chybu. Tu lze ignorovat zašktrnutím volby "Ignore bitstream errors", v takovém případě to jen lupne a hraje dál.

Žádný program není schopen to převést zpět do Wavu, protože se konverze vždy zhroutí na chybě. MonkeyAudio nemá žádnou volbu na ignorování chyby při zpětné dekompresi.

Má někdo ještě nějaký nápad?
Kdyby to šlo nějak převést do wavu, tak bych z toho lupanec vystříhnul.
Ale co mám dělat s nějakým blbým APE?