Mám externí USB HDD rozdělený na 2 partitions. První malá je nešifrovaná a na ní mám zkopírovaný program TrueCrypt (stačí, když si po instalaci zkopíruješ složku programu z "Program Files"). Když ho připojím k nějakému počítači, spustím program z té nešifrované partition a připojím tu druhou + zadám heslo a normálně to funguje.
Takže když budeš mít kompletně zaheslovaný disk a připojíš ho jinde, tak ho uvidíš jen jako hardware bez přiřazených písmen pro jednotky, ale pokud na tom stroji spustíš TrueCrypt a připojíš ho při zadání správného hesla, tak se k datům dostaneš.
Rozhodně však doporučuji mít od takto chráněných dat druhou kopii, protože v tomto případě při havárii disku bude obnovení dat téměř nemožné.