Našel jsem poměrně zajímavé řešení deduplikace na klientovi pro FreeNAS: https://www.ixsystems.com/blog/asigra-plugin/
Je zdarma pro nasazení do 10 počítačů, takže jako řešení na doma je to postačující, nicméně to celé všechno vypadá ještě poměrně nezrale.