Jakym zpusobem nastavim ve Firefoxu napr. hlavni stranku, proxy server a dalsi veci centralne, napr. pomoci domenovych politik?

což o to, ono tohle konkrétně lze, díky tomu, že FF má konfiguraci v textové podobě, takže si člověk může napsat skript (a ten si dát do GPO), kterým se to dá vyřešit (onehdá jsem zde na poradně jeden takový na změnu proxy psal ve VBS), jenže to není tak easy, jako naklikat to přímo v GPMC. Daleko horší je "neřiditelnost" používání doplňků, problémy s hromadnou instalací, aktualizací (aktualizace lze ještě jakžtakž vyřešit nastavením práv).

ad linux:

máš naprostou pravdu. Naštěstí se díky různým webovým aplikacím apod. začíná blýskat alespoň trochu na lepší časy. Na reálné nasazení do velké firmy (jako nehomogenní desktop) to ale ještě opravdu není.