Použij na opravu wmv repair program :
http://www.stahuj.cz/multimedia/ostatni/asfavirmwmv -repair/
pak by převod mohl být úspěšný. Klidně taky použij Windows Movie Maker
a problematickou část vyštípni.
Na převod do jiného formátu doporučuji free STOIK Video Converter :
http://www.slunecnice.cz/product/STOIK-Video-Conver ter/