Myslím, že se ti to snaží říci, že X-Window system nesmí běžet, ne že systém nesmí běžet (ten běžet samozřejmě musí). Vmware Tools se v linuxu neinstalují v grafickém prostředí. Zkus Ctrl-Alt-Backspace, to by mělo Xka shodit (nemam ale tušení co to udělá v MDK, třeba se jen restartnou)