No asi jsi čistila tak důkladně,že jsi smazala něco navíc.Vypadá to na bootmgr.
Nevím jestli to pomůže,ale něco o opravě píšou tady:
http://www.i-skladka.cz/index.php?option=com_conte nt&view=article&id=102:jak-eit-chybu-bootmgr-chybi -missing-bootmgr-win-7&catid=5:clanky-pc-ostatni-& Itemid=5

K vyřešení problému bude potřeba instalačního CD Win 7. Vložte jej do mechaniky a nabootujte z něj (pokud je potřeba změnit pořadí bootování návod zde). Pozn.: Může trvat celkem dlouho než se instalátor systému načte a tento čas vypadá, jakoby počítač nepracoval. Vyčkejte tedy alespoň 5 minut. Jakmile se objeví tabulka s volbou jazyka instalace, nějaký zvolte a klikněte na další.

V dalším kroku klikněte na položku "Repair your computer" resp. "Opravit počítač" Nyní počítač automaticky začne scanovat instalace systému a hledat problém. Problém obvykle nalezne a vybídne Vás k jeho opravení, tedy klikněte na "Repair and Restart" resp. "Opravit a restartovat". Problém vyřešen.