Takže dobojováno !!!

Postup:

1. Skopíroval som zložku Boot z ATA do C: /myslím, že nebolo potrebné, ale pre istotu.../
2. V správe diskov (ako správne poznamenal Dodek "Ten disk C: (s Windows) na 500GB SATA musi mat priznak "Active partition".) som ho nastavil ako aktívny
3. Spustil som CMD ako administrátor a zadal príkaz: bcdboot c:\Windows /s C:
4. Po reštarte som nastavil v BIOS-e poradie bootovania

Sláva, podarilo sa. Skvelé Windows 7. Vystačil som si s nástrojmi priamo v OS...

P.S. Ešte idem urobiť "cable management" a zatváram bedňu.