To, že se točí disk, znamená jenom to, že je pod napětím a s nějakým softwarovým (ne)připojením do systému to víceméně nesouvisí. Je to letitá záležitost, že po vypnutí zůstávají USB porty pod napětím. U desktopových desek to někdy jde vypnout vhodným nastavením BIOSu (nebo jumperem na desce), u jiných zase ne. Např. mám v práci desku, která po připojení k síti neposílá do USB žádné napětí a po zapnutí pro změnu posílá napětí stále (i po vypnutí), dokud nevytáhnu šňůru ze zásuvky.
Notebooky jsem tolik nezkoumal, ale dost pochybuji, že by se to dalo v BIOSu nastavit (možná jak kde). V každém případě ale počítej s tím, že i kdyby se podařilo tohle nastavit, tak se napětí na portu každopádně vypne až s vypnutím notebooku, ne hned po "bezpečném odpojení".