Tohle je záležitost POUZE mezi zdrojem a holou deskou, žádný CPU či paměť do toho nemohou zasahovat. Buď je vadný zdroj, to se mi ale nezdá, nebo deska posílá signál k zapnutí, který pomine. Zkus zapnout zdroj s odpojenou deskou (snad jenom ponechat např. disk jako minimální zátěž), jestli se na zdroji protočí ventilátory. Pokud ano, tak to pravděpodobně dělá zdroj a bude na tobě se rozhodnout, jestli ti to chvilkové naskočení vadí (osobně bych to nepovažoval za nebezpečné).
Pokud to dělá deska, tak bych zkusil Clear CMOS (jumperem na desce)