Neotevírej audio stopu zvlášť, ve VirtualDubu zatrhni Synchronizovat
Audio a Video. Předpokládám, že všechna avi jsou ve stejném rozlišení
a se stejným typem audia. Můžeš taky splácnout všechno dohromady
ve Windows Movie Makeru, ovšem výstup bude wmv.
Případně použij free AviSplit Classic :

http://www.slunecnice.cz/product/AviSplit-Classic/

Takových programů je mega hafo.