U MSI desek se tuším zvlášť nastavoval priorita pro boot RAID nabo ATA řadič. Je to jiná volba než priorita zařízení pro boot - CD, HDD apod.
Nesmí se pak zapomenout, ze Windows 2000 SP2 neumí pracovat s disky nad 136MB, takže ten 200GB disk bude dělat problémy.