prohledej co se ti samo spouští v msconfig.exe - po spuštění
stejně tak by šel projít seznam služeb (services.msc), ale od win7 je už celkem dlouhý
a samozřejmě naplánované úlohy, i tam se chkdsk/chkntfs mohl přidat.
tuneup zase klidně odinstaluj a zapomeň, že taková blbost existuje.