něco o možných problémech s bootsektorem jsem psal.
nepíšeš jaký systém jsi zálohoval a jaké oddíly z něj.
xp: http://www.tipypropc.cz/konzola-pro-zotaveni-a-pri kazy-fixmbr-a-fixboot/
w7: http://www.youtube.com/watch?v=j4KBjT-Xfgo
a nezapomenout na ten aktivní oddíl.