Jistě, formátem to definitivně vyřešíš!
Ty potřebuješ pouze pořešit zaváděcí část, ale pokud jsi opravdový wokenní sadomasochista, tak neváhej a formátuj.
Pro nastavení bootování z CD/FD vstupuješ do BIOSu podle instrukcí v manuálu? Můžeš sem přepsat přehledovou tabulku diskových oddílů tak jak ji vidíš v MiniTool Partition Wizard na jiném PC?