Nejako nechapem vyznam bat suboru v tomto pripade (batch znamena "davka" - hodi sa ak potrebujes spustat prikazov viac).
Si pravym (nie lavym!) tlacitkom mysi chyt ten exe, presun na plochu, ked pustis prave tlacitko tak vyskoci okno ze co ma urobit a tam si kliknes na "vytvorit zastupcu". Potom ti staci na toho zastupcu na ploche poklepat. Ak chces aby sa spustal pri starte Windows tak si toho zastupcu presunies do Start-Programy-Po spusteni (na to si klikni pravym - otvorit a presun tam toho zastupcu).

P.S. ak budes potrebovat tomu programu dat nejake parametre z prik.riadky tak si klikni na zastupcu - vlastnosti a tam si uprav prikazovy riadok ako chces.
P.S.2. ak nechces aby sa prikazovy riadok po ukonceni programu zavrel, tak si v tom zastupci (vo vlastnostiach) uprav ten prikaz na:

cmd /k C:\aplikace\uptime\uptime.exe