Při příležitosti toho, že jsem hledal kde jsou favicons v IE 7 uložené jsem našel řešení tohoto problému - patřičný link je potřeba označit jako "jen pro čtení" a při načtení stránky se do něj IE 7 nepodaří vložit novou ikonu - souvisí to s ukládáním ikon jako alternate data streamu do linků samotných.