Mám interní čtečku a ze začátku jsem ji taky vždycky odpojoval (ikonou v systray) před vysunutím karty...

Pak jsem to zkusil jednou bez vypnutí, podruhé, potřetí... a teď už normálně kartu vždycky vyrvu a s ničím se nezdržuju. (Samozřejmě když se na kartu nezapisuje.) Nevím, nakolik to je nebo není bezpečné, ale zatím jsem žádný problém nezaznamenal.