Já jsem nikdy potíže s windows při změně neměl ani ve Win98SE , ani ve WinXP a to ani při přechodu z chipsetu SIS na Intel a nebo z Intelu na nForce. Windows XP se v pohodě rozběhly i když se nainstalovány na skládaném PC s Celeronem přemístily na HDD do serveru s dvěma PIII. To vše ale neznamená, že v tvém případě problémy nebudou.
V tvé otázce chybí upřesnění, jaký OS a také jaká je původní a nová deska ( alespoň chipset).
Odpověď na tvoji otázku zní: možná ano a možná ne