FAT32 max. velikost souboru cca 4GB.

NTFS není pro flashdisky (paměťovky apod.) určeno a občas dělá na těchhle zařízeních problémy.
FAT32 je univerzální, funguje prakticky všude. Od starých telefonů, přes staré Windows, až přes moderní telefony s různými operačními systémy apod.
NTFS je specialita Microsoftu a funguje tak korektně hlavně pod Windows. Některé další systémy ho umí číst taky, ale není to úplně ideální (např. zápis).

Většina telefonů NTFS asi nepřečte, protože pro to nemají podporu, neočekává se to. NTFS je dělané primárně pro magnetické HDD.

Pokud chceš ukládat víc, jak 4GB soubory, zkus spíš ex-FAT. Všechny normální telefony by to měly podporovat a je taky celkem univerzální.