Splietas dve na tri dokopy. UEFI nema nic spolocne s FAT32 ani to nijak nesuvisi. Ak si schopny vytvorit tam emulaciu DVD pomocou iso suboru, tak to vytvor a bude sa to spravat presne tak jak normalne DVD (instalacne DVD Win8 alebo Win7 64bit je mozne bootovat aj v UEFI mode aj bez).

P.S. ak tomu tvojmu "instalovat přes UEFI nikoliv přes BIOS". UEFI je BIOS. Je to jedna a ta sama vec.