A co má být cílem? Normální postup je:

1) Jako první je vždycky instalace Windows

2) a) pokud chcete využít rychlost SSD i při bootu, pak je dalším krokem instalace ubuntu a v ní instalace zavaděče (grub) do boot sectoru SSD
nebo b) pokud nechcete, aby se linux dotykal SSD, přepnout v BIOSu boot na druhý disk a nainstalovat ubuntu se zavaděčem na tomto disku.

V obou případech linux najde instalaci windows a přidá jí do volby grubu. Volba operačního systému se pak provádí v GRUBu, nikoli obskurdním přepínáním v biosu.