Pokud máš místo na cílovém médiu omezené, tak komprimovat.
Vhodné je použít inkrementální zálohování. Tzn. že se přizálohují jen "rozdíly" mezi v minulosti vytvořeným archívem a stávajícími zdrojovými daty. U externího disku počet přepisů vůbec neřeš, nemá to smysl. Zkus se podívat na Cobian Backup.