Ne, žádnou rekalibraci nikde nenajdeš a ani nepotřebuješ, Windows "měří" velikost dobře.
Akorát musíš počítat s tím, že od WinVista jádro Windows podporuje a užívá tzv. "softlinks" a "hardlinks", dále mohou být některé soubory komprimované atd. Tohle vše některé souborové manažery nemusí správně pochopit a mohou tak ukazovat navzájem různou velikost obsazeného místa.
Pro pátrání zkus nějaký program zobrazující informace o velikostech souborů na disku, např. TreeSize, WinDirStat, SequoiaView, a mnoho dalších.