jestli dvě karty "měnily PCIe linky", tak to máš:

1. blbě smontované a grafika není plně zasunuta v slotu
2. blbé distančky pod deskou (nebo nějakou prasoskříň od ErrorCase a podobných šmejdmakerů), a grafiku nelze plně zasunout do slotu
3. zasrané kontakty v PCIe slotu (prach, broky, bordel)
4. vadnou desku

bodům 1-2. by odpovídalo to, že se karta provozem prohřeje a pak se dilatací materiálu samovolně vysune se slotu.

edit: jak psal MM, prvotní diagnostika v takto "strašidelných PC" se dělá s PC složeným mimo budku.