řek bych že na velké soubory je ten e: disk těsný. vyprázdnil bych ho, zrušil a roztáhnul místo něj ntfs d:
jinak snad není v ničem problém že soubor je jen 1x nebo 2x fregmentován (až víc velkých souborů si tam začne překážet).
nicméně strukturu ntfs neznám, a nevím jak metadata umísťuje, nebo s nimi hýbe. možná v článcích vpravo bylo něco.