Předpokládám, že je to nová instalace OS - tzn. žádný další nainstalovaný software (kromě ovladačů).
Pokud ne, problém bude asi v načítání aplikací v msconfig - karta Po spuštění, dále Služby, Plánovač úloh, Viry/Trojany. Když to spustíš do nouzového režimu, tak je ta doba stejná nebo výrazně nižší?