vidíš skript v \\doména\NETLOGON ?
V profilu máš nastaveno \\doména\netlogon\logon.bat ?
Pokud ne, máš to blbě. Podle mě jsi smíchal skript spouštěný při startu aplikovaný v group policies se "starým" způsobem aplikace login skriptu přes profil uživatele.