1. ne, chyby se nepřesunou. Přesunou se ale poškozená data
2. co se může přesunout, jsou označené vadné bloky v NTFS - pak je třeba pomocí chkdsk a volby /b provést pro jistotu znovuvyhodnocení označených vadných clusterů.
3. klon tedy můžeš udělat, na HW to vliv mít nebude. Dopoučuju po klonování provést: 3 kroky:

a. chkdsk viz výše (na všech svazcích, co byly na disku)
b. sfc /scannow (tím vyloučíš chyby v OS zatažené původním vadným diskem)
c. zkontrolovat uživatelská data, alespoň ta nejdůležitější.