Zobrazování skrytých a systémových složek pomůže jen k tomu, že je vidíš. To ale neznamrená, že k nim máš přístup a tím pádem nezjistíš jejich velikost.
Pokud je to opravdu externí disk, pak všechny složky jako RecycleBin, System Volume Information apod. můžeš smazat.
V podstatě smazat můžeš na externím disku vše, co sis tam vědomě nenahrál.