Buď ozálohuješ celý oddíl Windows, a pak budeš mít komplet zálohu (Windows záloha, Acronis, AOMEI,...), nebo to budeš muset vyzobat z %appdata%, registrů, popř. programdata a program files ručně, v závislosti na tom, kam ten který program rozesel svá nastavení.
Nejrychlejší záloha je postup:
1. vyčistění pomocí Windows clean od starých updatů, tempů apod.
2. restart
3. záloha pomocí Windows backup na jiný oddíl v PC.