V podstatě není nutné ani dodržet stejnou cestu. Osobně bych ti doporučil si udělat zvláštní složku pro VirtualBox, klidně C:\VirtualBox a tam nasměrovat všechny stroje i konfigurační soubory.
Pokud pak nainstaluješ virtualBox a otevřeš .VBOX soubor, budeš mít virtuální stroj zpět. Nejhorší, co se může stát je, že budeš muset ukázat cestu na VDI soubor (virtuální disk)