Pokud je vše tak jak píšeš (odpojený druhý disk při instalaci na SSD), není zaručeno, že to může časem zlobit.
Je všeobecně známo, že nové verze Windows, instalované na NTFS si vzájemně lezou do zelí. Bootujeme-li dva systémy pomocí přepínání v BIOSu, tak si každá verze "cosi" poznamená na i na druhém disku.
V lepším případě to po zapnutí počítače vyřeší automatická kontrola disku. Protože desítky jsou zvlášť aktivní a stále něco kutí s disky, může kolaps nastat až po nějaké aktualizaci. Do desítek člověk nevidí...