Postupuj,jak píšeš,prvotní bootování + instalace na SSD. Starý systém z druhého disku + všechny jeho složky vymažeš případně ručně.Pokud máš na mysli dual,tak to jde nastavit a používat oba systémy. Nastavíš buď přes soft EasyBCD,nebo ručně F12 a vybereš boot z HDD.