Předtím to fungovalo výborně.

To znamená před čím? Něco jsi do počítače instaloval/odinstaloval, nebo jsi měnil nějaký hardware, či co?

mám v PC 2 Hd s tím samým operačním systémem

To znamená co? To je nějaký klon toho prvního OS? Zkusil jsi na některý z těch disků nainstalovat OS nanovo?

Pokud ti systém v nouzovém režimu najede, tak musíš hledat to, co se naopak navíc spouští jenom v normálním režimu (programy v Po spuštění, Služby, Plánovač úloh, další software - třeba i viry).