Tak změna. Podle návodu http://visihow.com/Show_Hidden_Files_Using_Command _Prompt , který jsem viděl v podobném tématu zde, se mi podařilo složky zobrazit. Nějak se mi při tom kopírování nastavilo, aby se nezobrazovaly skryté složky a soubory - nevím proč, nikdy jsem to zobrazení nezamykal. Každopádně vyřešeno.