data aplikací a jejich konfigurace se ukládají do uživatelského profilu, nicméně každý autor aplikace si může dělat co chce a může ukládat třeba do program files, nebo do dokumentů v uživatelském profilu. a ano některé programy ukládají do registru. záleží na účelu aplikace a rozhodnutí autora. proč všichni neukládají do registru? protože jim to je jedno, nebo v tom nevidí důvod.

kdyby sis přečetl můj příspěvek o trochu výš, dozvěděl by ses jak provést migraci nastavení a dat uživatele mezi počítači s pomocí nástroje Nástroje Migrace profilu uživatele. Také ještě na to existuje nástroj USMT.

mimochodem, proč jsi nepoužil google? :)