Zmena hesla sa robí tak, že zastavíš server, vytvoríš súbor s príkazom pre zmenu hesla a spustíš server s parametrom init-file, ktorý ukazuje na ten súbor s príkazom pre zmenu hesla. Podrobný popis je v manuáli:
Príkaz na zmenu hesla:
ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED BY 'MyNewPass';
Spustenie MySQL servera s parametrom init-file:mysqld --init-file=C:\\mysql-init.txt